L'Ente è amministrato da un Consiglio di Amministrazione (CdA) che svolge funzioni di indirizzo, programmazione e controllo ed è composto da sette membri, compreso il Presidente, di cui:
- cinque nominati dal Comune di Canzo;
- il parroco pro-tempore di Canzo;
- il rappresentante della famiglia Balossi-Gavazzi.
I membri durano in carica cinque anni decorrenti dalla data di insediamento del Consiglio.